工厂工作两天辞职通常没有经济补偿。具体可分情况说明：若处于试用期且主动辞职，一般无补偿，因为试用期内劳动者提前三日通知即可解除合同；若工厂存在《劳动合同法》第三十八条规定的未提供劳动保护、未及时足额支付报酬、未缴社保等情形，劳动者据此辞职的，有权要求补偿。
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在工厂工作两天后辞职，可能存在工资风险。若未明确工资结算事宜，也未保留工作证据，工厂可能以工作时间短为由拖欠或克扣工资。例如，工厂以两天工作未达绩效标准为由拒付全部工资，而劳动者又无法提供有效证据证明工作情况和工资标准，就可能拿不到足额工资。
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工厂工作两天辞职是否有补偿，法律有明确规定。根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条（2012年修正版），试用期内劳动者提前三日通知用人单位可解除合同，工作两天若处于试用期且主动辞职并提前通知，属于合法解除，单位无需补偿。同时，《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条规定了单位应支付经济补偿的情形，如单位有过错时劳动者辞职等，但工作两天主动辞职且单位无过错的，不符合这些情形，所以一般无补偿。
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工厂工作两天辞职的处理，可能受特殊情况或例外情形影响：一是工厂存在《劳动合同法》第三十八条规定的违法行为，如未提供劳动保护、未及时足额支付报酬等，劳动者据此辞职的，有权要求补偿，这与一般主动辞职不同；二是双方签订了特殊劳动合同条款，若条款不违反法律强制性规定，约定了工作两天辞职也有补偿，劳动者可依据约定获得补偿。
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